Protein–RNA interactions for Protein: P97358

Taf1b, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1bP97358 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Taf1bP97358 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Taf1bP97358 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Taf1bP97358 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Taf1bP97358 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.2 ms