Protein–RNA interactions for Protein: P97353

Sec1, Galactoside 2-alpha-L-fucosyltransferase 3, mousemouse

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec1P97353 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Sec1P97353 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sec1P97353 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec1P97353 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec1P97353 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec1P97353 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec1P97353 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Sec1P97353 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sec1P97353 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec1P97353 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sec1P97353 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sec1P97353 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec1P97353 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec1P97353 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec1P97353 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sec1P97353 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.9 ms