Protein–RNA interactions for Protein: P97326

Cdh6, Cadherin-6, mousemouse

Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdh6P97326 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Cdh6P97326 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Cdh6P97326 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Cdh6P97326 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Cdh6P97326 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms