Protein–RNA interactions for Protein: P97313

Prkdc, DNA-dependent protein kinase catalytic subunit, mousemouse

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Length 4,128 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrkdcP97313 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
PrkdcP97313 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Gfra4-201ENSMUST00000028787 909 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
PrkdcP97313 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Cdkn2a-201ENSMUST00000060501 852 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
PrkdcP97313 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
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