Protein–RNA interactions for Protein: P97299

Sfrp2, Secreted frizzled-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 295 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp2P97299 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp2P97299 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp2P97299 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp2P97299 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp2P97299 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp2P97299 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Sfrp2P97299 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.3
Sfrp2P97299 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Sfrp2P97299 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Sfrp2P97299 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfrp2P97299 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfrp2P97299 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Sfrp2P97299 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms