Protein–RNA interactions for Protein: P86448

Trim43b, Tripartite motif-containing protein 43B, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43bP86448 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim43bP86448 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim43bP86448 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim43bP86448 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms