Protein–RNA interactions for Protein: P80560

Ptprn2, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase N2, mousemouse

Predictions only

Length 1,001 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptprn2P80560 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Ptprn2P80560 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptprn2P80560 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptprn2P80560 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptprn2P80560 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 76.5 ms