Protein–RNA interactions for Protein: P80318

Cct3, T-complex protein 1 subunit gamma, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cct3P80318 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cct3P80318 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cct3P80318 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cct3P80318 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cct3P80318 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Cct3P80318 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cct3P80318 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cct3P80318 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Cct3P80318 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cct3P80318 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cct3P80318 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Cct3P80318 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cct3P80318 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Cct3P80318 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cct3P80318 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Cct3P80318 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cct3P80318 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cct3P80318 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.38■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cct3P80318 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
Cct3P80318 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Cct3P80318 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms