Protein–RNA interactions for Protein: P80206

Otx2, Homeobox protein OTX2, mousemouse

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otx2P80206 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Otx2P80206 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otx2P80206 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Otx2P80206 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Otx2P80206 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx2P80206 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Otx2P80206 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otx2P80206 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Otx2P80206 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Otx2P80206 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms