Protein–RNA interactions for Protein: P70700

Polr1b, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA2, mousemouse

Predictions only

Length 1,135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1bP70700 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Polr1bP70700 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.75■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Polr1bP70700 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Polr1bP70700 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms