Protein–RNA interactions for Protein: P70698

Ctps1, CTP synthase 1, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctps1P70698 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Ctps1P70698 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ctps1P70698 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ctps1P70698 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ctps1P70698 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms