Protein–RNA interactions for Protein: P70354

Msx3, Homeobox protein MSX-3, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Msx3P70354 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msx3P70354 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Msx3P70354 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Msx3P70354 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Msx3P70354 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msx3P70354 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msx3P70354 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msx3P70354 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Msx3P70354 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Msx3P70354 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Msx3P70354 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Msx3P70354 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx3P70354 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx3P70354 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msx3P70354 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx3P70354 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Msx3P70354 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms