Protein–RNA interactions for Protein: P70280

Vamp7, Vesicle-associated membrane protein 7, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp7P70280 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vamp7P70280 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Vamp7P70280 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vamp7P70280 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms