Protein–RNA interactions for Protein: P70268

Pkn1, Serine/threonine-protein kinase N1, mousemouse

Predictions only

Length 946 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkn1P70268 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Pkn1P70268 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pkn1P70268 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pkn1P70268 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pkn1P70268 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13 ms