Protein–RNA interactions for Protein: P70217

Hoxd13, Homeobox protein Hox-D13, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hoxd13P70217 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Hoxd13P70217 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Hoxd13P70217 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hoxd13P70217 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hoxd13P70217 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 80.8 ms