Protein–RNA interactions for Protein: P70211

Dcc, Netrin receptor DCC, mousemouse

Predictions only

Length 1,447 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DccP70211 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
DccP70211 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DccP70211 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DccP70211 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
DccP70211 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
DccP70211 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DccP70211 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DccP70211 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
DccP70211 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DccP70211 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DccP70211 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
DccP70211 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DccP70211 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DccP70211 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DccP70211 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DccP70211 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DccP70211 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
DccP70211 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC29.66■■■□□ 2.34
DccP70211 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DccP70211 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DccP70211 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DccP70211 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
DccP70211 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC29.64■■■□□ 2.34
DccP70211 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DccP70211 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
DccP70211 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DccP70211 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DccP70211 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DccP70211 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DccP70211 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC29.63■■■□□ 2.33
DccP70211 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DccP70211 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
DccP70211 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DccP70211 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DccP70211 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.62■■■□□ 2.33
DccP70211 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DccP70211 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DccP70211 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DccP70211 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
DccP70211 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DccP70211 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
DccP70211 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DccP70211 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DccP70211 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC29.59■■■□□ 2.33
DccP70211 Sumf1-206ENSMUST00000172188 723 ntTSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DccP70211 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.59■■■□□ 2.33
DccP70211 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
DccP70211 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
DccP70211 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
DccP70211 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DccP70211 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
DccP70211 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DccP70211 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
DccP70211 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
DccP70211 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC29.57■■■□□ 2.32
DccP70211 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC29.56■■■□□ 2.32
DccP70211 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DccP70211 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DccP70211 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
DccP70211 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DccP70211 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DccP70211 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DccP70211 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
DccP70211 Rtca-201ENSMUST00000000348 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DccP70211 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.54■■■□□ 2.32
DccP70211 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.54■■■□□ 2.32
DccP70211 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC29.54■■■□□ 2.32
DccP70211 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DccP70211 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC29.53■■■□□ 2.32
DccP70211 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DccP70211 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.53■■■□□ 2.32
DccP70211 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DccP70211 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DccP70211 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.53■■■□□ 2.32
DccP70211 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DccP70211 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DccP70211 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DccP70211 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DccP70211 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DccP70211 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DccP70211 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.52■■■□□ 2.32
DccP70211 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.52■■■□□ 2.32
DccP70211 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DccP70211 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.32
DccP70211 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DccP70211 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC29.51■■■□□ 2.31
DccP70211 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DccP70211 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.51■■■□□ 2.31
DccP70211 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DccP70211 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DccP70211 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC29.5■■■□□ 2.31
DccP70211 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC29.5■■■□□ 2.31
DccP70211 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.49■■■□□ 2.31
DccP70211 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC29.49■■■□□ 2.31
DccP70211 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DccP70211 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC29.48■■■□□ 2.31
DccP70211 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
DccP70211 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC29.47■■■□□ 2.31
DccP70211 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
DccP70211 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.6 ms