Protein–RNA interactions for Protein: P70208

Plxna3, Plexin-A3, mousemouse

Predictions only

Length 1,872 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Plxna3P70208 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
Plxna3P70208 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Plxna3P70208 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Plxna3P70208 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Plxna3P70208 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms