Protein–RNA interactions for Protein: P70193

Lrig1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,091 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig1P70193 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Lrig1P70193 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Lrig1P70193 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Lrig1P70193 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Lrig1P70193 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.2 ms