Protein–RNA interactions for Protein: P63328

Ppp3ca, Serine/threonine-protein phosphatase 2B catalytic subunit alpha isoform, mousemouse

Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp3caP63328 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Ppp3caP63328 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Ppp3caP63328 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ppp3caP63328 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp3caP63328 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp3caP63328 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Ppp3caP63328 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp3caP63328 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ppp3caP63328 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms