Protein–RNA interactions for Protein: P63044

Vamp2, Vesicle-associated membrane protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp2P63044 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Vamp2P63044 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Vamp2P63044 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Vamp2P63044 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms