Protein–RNA interactions for Protein: P62874

Gnb1, Guanine nucleotide-binding protein G(I)/G(S)/G(T) subunit beta-1, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gnb1P62874 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Gnb1P62874 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Gnb1P62874 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
Gnb1P62874 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 71.2 ms