Protein–RNA interactions for Protein: P62858

Rps28, 40S ribosomal protein S28, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 69 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rps28P62858 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Oxsr1-201ENSMUST00000040853 4647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Syt17-203ENSMUST00000203485 1932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Rps28P62858 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 4930519A11Rik-201ENSMUST00000181381 1523 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.32
Rps28P62858 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC13.02□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC13.01□□□□□ -0.33
Rps28P62858 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
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