Protein–RNA interactions for Protein: P62761

Vsnl1, Visinin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsnl1P62761 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Vsnl1P62761 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Vsnl1P62761 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC22.64■■□□□ 1.22
Vsnl1P62761 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Vsnl1P62761 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms