Protein–RNA interactions for Protein: P62331

Arf6, ADP-ribosylation factor 6, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arf6P62331 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf6P62331 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arf6P62331 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Arf6P62331 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf6P62331 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Arf6P62331 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Arf6P62331 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arf6P62331 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Arf6P62331 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Arf6P62331 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122.3 ms