Protein–RNA interactions for Protein: P62192

Psmc1, 26S proteasome regulatory subunit 4, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmc1P62192 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Psmc1P62192 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Psmc1P62192 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmc1P62192 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmc1P62192 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 92.1 ms