Protein–RNA interactions for Protein: P61087

Ube2k, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 K, mousemouse

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2kP61087 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Ube2kP61087 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Ube2kP61087 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Ube2kP61087 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ube2kP61087 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.6 ms