Protein–RNA interactions for Protein: P60879

Snap25, Synaptosomal-associated protein 25, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap25P60879 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap25P60879 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap25P60879 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap25P60879 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap25P60879 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap25P60879 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Snap25P60879 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
Snap25P60879 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap25P60879 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Snap25P60879 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms