Protein–RNA interactions for Protein: P59235

Nup43, Nucleoporin Nup43, mousemouse

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nup43P59235 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup43P59235 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup43P59235 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup43P59235 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Nup43P59235 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup43P59235 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Nup43P59235 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Nup43P59235 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Nup43P59235 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.9 ms