Protein–RNA interactions for Protein: P58404

Strn4, Striatin-4, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Strn4P58404 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Strn4P58404 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Strn4P58404 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Strn4P58404 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Strn4P58404 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Strn4P58404 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Strn4P58404 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Strn4P58404 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Strn4P58404 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Strn4P58404 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Strn4P58404 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Strn4P58404 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Strn4P58404 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Strn4P58404 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Strn4P58404 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Strn4P58404 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Strn4P58404 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
Strn4P58404 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Strn4P58404 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Strn4P58404 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Strn4P58404 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Strn4P58404 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Strn4P58404 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Strn4P58404 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Strn4P58404 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
Strn4P58404 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Strn4P58404 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Strn4P58404 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Strn4P58404 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Strn4P58404 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Strn4P58404 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
Strn4P58404 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Pi16-201ENSMUST00000114699 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Strn4P58404 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Strn4P58404 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Strn4P58404 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Strn4P58404 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Strn4P58404 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Strn4P58404 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Strn4P58404 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Strn4P58404 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Strn4P58404 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Strn4P58404 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms