Protein–RNA interactions for Protein: P58269

Dpf3, Zinc finger protein DPF3, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dpf3P58269 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Dpf3P58269 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Bcas2-201ENSMUST00000005830 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Dpf3P58269 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Dpf3P58269 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Cog1-202ENSMUST00000063776 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Dpf3P58269 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms