Protein–RNA interactions for Protein: P58242

Smpdl3b, Acid sphingomyelinase-like phosphodiesterase 3b, mousemouse

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpdl3bP58242 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Smpdl3bP58242 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Smpdl3bP58242 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Smpdl3bP58242 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms