Protein–RNA interactions for Protein: P58064

Mrps6, 28S ribosomal protein S6, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrps6P58064 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Mrps6P58064 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Mrps6P58064 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Mrps6P58064 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrps6P58064 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrps6P58064 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrps6P58064 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Mrps6P58064 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrps6P58064 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrps6P58064 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Mrps6P58064 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms