Protein–RNA interactions for Protein: P57784

Snrpa1, U2 small nuclear ribonucleoprotein A', mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrpa1P57784 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Snrpa1P57784 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Snrpa1P57784 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Snrpa1P57784 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Snrpa1P57784 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78 ms