Protein–RNA interactions for Protein: P57716

Ncstn, Nicastrin, mousemouse

Predictions only

Length 708 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NcstnP57716 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcstnP57716 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
NcstnP57716 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
NcstnP57716 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
NcstnP57716 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NcstnP57716 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
NcstnP57716 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcstnP57716 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Fezf2-203ENSMUST00000224714 2429 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
NcstnP57716 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NcstnP57716 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
NcstnP57716 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms