Protein–RNA interactions for Protein: P56812

Pdcd5, Programmed cell death protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcd5P56812 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Pdcd5P56812 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Pdcd5P56812 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Pdcd5P56812 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Pdcd5P56812 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms