Protein–RNA interactions for Protein: P56581

Tdg, G/T mismatch-specific thymine DNA glycosylase, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TdgP56581 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TdgP56581 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TdgP56581 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TdgP56581 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TdgP56581 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TdgP56581 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TdgP56581 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TdgP56581 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TdgP56581 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TdgP56581 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TdgP56581 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TdgP56581 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TdgP56581 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TdgP56581 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TdgP56581 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TdgP56581 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TdgP56581 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TdgP56581 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TdgP56581 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TdgP56581 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TdgP56581 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
TdgP56581 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TdgP56581 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TdgP56581 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TdgP56581 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TdgP56581 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TdgP56581 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TdgP56581 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TdgP56581 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TdgP56581 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TdgP56581 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TdgP56581 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
TdgP56581 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TdgP56581 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
TdgP56581 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
TdgP56581 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TdgP56581 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
TdgP56581 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TdgP56581 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
TdgP56581 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TdgP56581 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TdgP56581 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TdgP56581 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TdgP56581 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
TdgP56581 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TdgP56581 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
TdgP56581 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TdgP56581 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TdgP56581 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TdgP56581 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TdgP56581 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
TdgP56581 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
TdgP56581 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TdgP56581 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TdgP56581 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TdgP56581 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TdgP56581 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
TdgP56581 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
TdgP56581 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
TdgP56581 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
TdgP56581 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
TdgP56581 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TdgP56581 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TdgP56581 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TdgP56581 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
TdgP56581 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TdgP56581 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TdgP56581 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TdgP56581 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TdgP56581 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
TdgP56581 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
TdgP56581 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
TdgP56581 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TdgP56581 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TdgP56581 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TdgP56581 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TdgP56581 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TdgP56581 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TdgP56581 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TdgP56581 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TdgP56581 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
TdgP56581 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TdgP56581 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TdgP56581 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TdgP56581 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TdgP56581 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TdgP56581 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
TdgP56581 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TdgP56581 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TdgP56581 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TdgP56581 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TdgP56581 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TdgP56581 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TdgP56581 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TdgP56581 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TdgP56581 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TdgP56581 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TdgP56581 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TdgP56581 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TdgP56581 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 162.8 ms