Protein–RNA interactions for Protein: P56400

Gp1bb, Platelet glycoprotein Ib beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gp1bbP56400 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gp1bbP56400 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gp1bbP56400 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Gp1bbP56400 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Gp1bbP56400 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms