Protein–RNA interactions for Protein: P56213

Gfer, FAD-linked sulfhydryl oxidase ALR, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GferP56213 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
GferP56213 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GferP56213 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
GferP56213 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
GferP56213 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GferP56213 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
GferP56213 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GferP56213 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
GferP56213 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GferP56213 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
GferP56213 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GferP56213 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GferP56213 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GferP56213 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GferP56213 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
GferP56213 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
GferP56213 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GferP56213 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GferP56213 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GferP56213 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
GferP56213 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
GferP56213 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GferP56213 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GferP56213 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GferP56213 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GferP56213 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GferP56213 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
GferP56213 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
GferP56213 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GferP56213 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GferP56213 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GferP56213 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GferP56213 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GferP56213 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GferP56213 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
GferP56213 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
GferP56213 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GferP56213 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
GferP56213 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GferP56213 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
GferP56213 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
GferP56213 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GferP56213 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GferP56213 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
GferP56213 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
GferP56213 Txnrd2-216ENSMUST00000206606 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
GferP56213 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GferP56213 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GferP56213 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GferP56213 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GferP56213 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GferP56213 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
GferP56213 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
GferP56213 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
GferP56213 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GferP56213 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GferP56213 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
GferP56213 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
GferP56213 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
GferP56213 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms