Protein–RNA interactions for Protein: P54830

Ptpn5, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptpn5P54830 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Zfp335os-201ENSMUST00000129364 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ptpn5P54830 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Pgk1-201ENSMUST00000081593 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Bloc1s4-201ENSMUST00000071949 1273 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ptpn5P54830 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ptpn5P54830 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 2004.9 ms