Protein–RNA interactions for Protein: P54729

Nub1, NEDD8 ultimate buster 1, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nub1P54729 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nub1P54729 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nub1P54729 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nub1P54729 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nub1P54729 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nub1P54729 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nub1P54729 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nub1P54729 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nub1P54729 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nub1P54729 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nub1P54729 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Nub1P54729 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Nub1P54729 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms