Protein–RNA interactions for Protein: P53798

Fdft1, Squalene synthase, mousemouse

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fdft1P53798 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fdft1P53798 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Fdft1P53798 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Fdft1P53798 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fdft1P53798 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms