Protein–RNA interactions for Protein: P52431

Pold1, DNA polymerase delta catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pold1P52431 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Tbc1d10a-206ENSMUST00000180088 1921 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold1P52431 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold1P52431 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Pold1P52431 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold1P52431 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold1P52431 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold1P52431 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pold1P52431 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pold1P52431 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold1P52431 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pold1P52431 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Pmpca-202ENSMUST00000114093 1638 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Pold1P52431 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Pold1P52431 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms