Protein–RNA interactions for Protein: P51906

Slc1a1, Excitatory amino acid transporter 3, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc1a1P51906 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Slc1a1P51906 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Slc1a1P51906 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Slc1a1P51906 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.8 ms