Protein–RNA interactions for Protein: P50716

Defa-rs12, Alpha-defensin-related sequence 12, mousemouse

Predictions only

Length 91 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Defa-rs12P50716 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Defa-rs12P50716 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Defa-rs12P50716 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Tspan17-201ENSMUST00000026993 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Defa-rs12P50716 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Defa-rs12P50716 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.6 ms