Protein–RNA interactions for Protein: P50652

Fancc, Fanconi anemia group C protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FanccP50652 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FanccP50652 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FanccP50652 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
FanccP50652 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
FanccP50652 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FanccP50652 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FanccP50652 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
FanccP50652 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
FanccP50652 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
FanccP50652 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FanccP50652 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FanccP50652 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
FanccP50652 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FanccP50652 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FanccP50652 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
FanccP50652 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
FanccP50652 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FanccP50652 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
FanccP50652 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FanccP50652 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FanccP50652 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
FanccP50652 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FanccP50652 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FanccP50652 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FanccP50652 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FanccP50652 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
FanccP50652 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
FanccP50652 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FanccP50652 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
FanccP50652 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FanccP50652 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FanccP50652 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FanccP50652 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
FanccP50652 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FanccP50652 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
FanccP50652 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
FanccP50652 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FanccP50652 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
FanccP50652 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FanccP50652 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
FanccP50652 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FanccP50652 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FanccP50652 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
FanccP50652 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FanccP50652 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
FanccP50652 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
FanccP50652 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FanccP50652 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
FanccP50652 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FanccP50652 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FanccP50652 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
FanccP50652 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
FanccP50652 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
FanccP50652 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FanccP50652 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FanccP50652 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FanccP50652 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FanccP50652 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FanccP50652 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FanccP50652 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
FanccP50652 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
FanccP50652 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
FanccP50652 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
FanccP50652 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanccP50652 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanccP50652 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanccP50652 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanccP50652 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanccP50652 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
FanccP50652 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanccP50652 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
FanccP50652 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanccP50652 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanccP50652 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanccP50652 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanccP50652 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanccP50652 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
FanccP50652 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FanccP50652 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FanccP50652 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
FanccP50652 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
FanccP50652 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.6 ms