Protein–RNA interactions for Protein: P50608

Fmod, Fibromodulin, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FmodP50608 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FmodP50608 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FmodP50608 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FmodP50608 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FmodP50608 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FmodP50608 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
FmodP50608 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
FmodP50608 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
FmodP50608 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC17.58■□□□□ 0.41
FmodP50608 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
FmodP50608 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FmodP50608 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
FmodP50608 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FmodP50608 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FmodP50608 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
FmodP50608 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FmodP50608 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FmodP50608 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FmodP50608 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
FmodP50608 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
FmodP50608 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
FmodP50608 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FmodP50608 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FmodP50608 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FmodP50608 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FmodP50608 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
FmodP50608 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FmodP50608 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FmodP50608 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
FmodP50608 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FmodP50608 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FmodP50608 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FmodP50608 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FmodP50608 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FmodP50608 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FmodP50608 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
FmodP50608 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FmodP50608 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
FmodP50608 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FmodP50608 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FmodP50608 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FmodP50608 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FmodP50608 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FmodP50608 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FmodP50608 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
FmodP50608 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
FmodP50608 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
FmodP50608 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FmodP50608 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FmodP50608 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FmodP50608 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
FmodP50608 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FmodP50608 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
FmodP50608 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
FmodP50608 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FmodP50608 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FmodP50608 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FmodP50608 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FmodP50608 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FmodP50608 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FmodP50608 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
FmodP50608 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
FmodP50608 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FmodP50608 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FmodP50608 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
FmodP50608 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FmodP50608 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
FmodP50608 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
FmodP50608 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FmodP50608 Cdk18-202ENSMUST00000112362 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FmodP50608 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
FmodP50608 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FmodP50608 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FmodP50608 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
FmodP50608 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FmodP50608 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
FmodP50608 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FmodP50608 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FmodP50608 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FmodP50608 Lrrc3b-201ENSMUST00000055211 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FmodP50608 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FmodP50608 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FmodP50608 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
FmodP50608 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FmodP50608 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
FmodP50608 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FmodP50608 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FmodP50608 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FmodP50608 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FmodP50608 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FmodP50608 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FmodP50608 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
FmodP50608 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FmodP50608 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FmodP50608 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FmodP50608 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FmodP50608 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
FmodP50608 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
FmodP50608 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
FmodP50608 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.4 ms