Protein–RNA interactions for Protein: P50284

Ltbr, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 3, mousemouse

Predictions only

Length 415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LtbrP50284 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LtbrP50284 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
LtbrP50284 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Gm13620-201ENSMUST00000131198 511 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
LtbrP50284 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
LtbrP50284 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
LtbrP50284 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
LtbrP50284 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LtbrP50284 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
LtbrP50284 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
LtbrP50284 AC140930.3-201ENSMUST00000222935 274 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
LtbrP50284 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
LtbrP50284 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LtbrP50284 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
LtbrP50284 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 70.7 ms