Protein–RNA interactions for Protein: P49222

Epb42, Erythrocyte membrane protein band 4.2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Epb42P49222 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Epb42P49222 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epb42P49222 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb42P49222 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb42P49222 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb42P49222 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epb42P49222 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epb42P49222 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Epb42P49222 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Epb42P49222 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb42P49222 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC21■□□□□ 0.95
Epb42P49222 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Epb42P49222 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb42P49222 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Epb42P49222 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Epb42P49222 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Epb42P49222 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Epb42P49222 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms