Protein–RNA interactions for Protein: P49025

Cit, Citron Rho-interacting kinase, mousemouse

Predictions only

Length 2,055 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CitP49025 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
CitP49025 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
CitP49025 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
CitP49025 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
CitP49025 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
CitP49025 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CitP49025 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CitP49025 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CitP49025 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
CitP49025 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
CitP49025 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CitP49025 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
CitP49025 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CitP49025 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CitP49025 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CitP49025 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CitP49025 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
CitP49025 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CitP49025 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
CitP49025 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
CitP49025 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
CitP49025 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
CitP49025 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CitP49025 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
CitP49025 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
CitP49025 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CitP49025 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
CitP49025 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
CitP49025 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CitP49025 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CitP49025 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
CitP49025 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CitP49025 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CitP49025 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CitP49025 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
CitP49025 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CitP49025 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CitP49025 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CitP49025 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
CitP49025 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CitP49025 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CitP49025 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CitP49025 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
CitP49025 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
CitP49025 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CitP49025 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CitP49025 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CitP49025 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CitP49025 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CitP49025 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CitP49025 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CitP49025 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
CitP49025 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
CitP49025 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
CitP49025 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CitP49025 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CitP49025 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CitP49025 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CitP49025 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CitP49025 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CitP49025 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CitP49025 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CitP49025 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CitP49025 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CitP49025 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CitP49025 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CitP49025 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CitP49025 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CitP49025 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CitP49025 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CitP49025 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CitP49025 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CitP49025 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CitP49025 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CitP49025 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CitP49025 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CitP49025 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms