Protein–RNA interactions for Protein: P48437

Prox1, Prospero homeobox protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 737 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prox1P48437 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prox1P48437 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Prox1P48437 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prox1P48437 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Prox1P48437 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prox1P48437 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prox1P48437 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prox1P48437 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Prox1P48437 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.5 ms